该项目由科技部与国家自然科学基金委员会组建重点规划项目联合办公室负责管理。申报项目应满足下述三项条件之一：
　　1． 围绕我国社会、经济和科技自身发展的重大需要，解决国家中长期发展中面临的重大关键问题的基础性研究；
　　2． 瞄准科学前沿重大问题，体现学科交叉、综合，探索科学基本规律的基础性研究；
　　3． 发挥我国的优势与特色，体现我国自然、地理与人文资源特点，能在国际科学前沿占有一席之地的基础性研究。

另外，有创新的学术思想，科学、可行的研究路线或技术方案。；有高水平的学术带头人和一支学术思想活跃、科研业绩优秀、团结协作、结构合理的科学研究队伍；具备良好的研究条件，能充分利用现有的研究基地和工作基开展研究工作。

    申报时间等详细情况见联合办通知。

    与此项目相关的管理文件有《国家重点基础研究发展规划项目管理暂行办法》、《国家重点基础研究专项经费财务管理办法》等。